شاهین ناصری، یکی از شاهدان شکنجه نوید افکاری، روز سه شنبه ۳۰ شهریورماه، در زندان تهران بزرگ به طرز پرابهامی درگذشت. صبح روز چهارشنبه ۳۱ شهریورماه، به خانواده شاهین ناصری اطلاع داده شد تا برای تحویل گرفتن جسد فرزند خود به دادسرای جنایی مراجعه کنند. دو روز بعد از انتشار خبر مرگ این زندانی، قوه قضاییه ایران مرگ او را تایید و در اطلاعیه‌ای بدون ذکر جزییات اعلام کرد که او به بهداری زندان مراجعه کرده و بعد از ۴۵ دقیقه درگذشته است. شهادت شاهین ناصری در مورد ضرب و شتم و شکنجه نوید و وحید افکاری در بازداشتگاه اداره آگاهی شیراز در پرونده مورد اشاره قرار گرفته بود اما این اظهارات هیچگاه مورد توجه دادگاه قرار نگرفت. در فایل صوتی که زمان ضبط آن، قبل از اعدام نوید افکاری است شاهین ناصری ضمن بیان بخشی از شکنجه‌های اعمال شده به نوید افکاری در آگاهی شیراز، اظهار داشت که “قاضی پرونده او گفته است که به دلیل دخالت در پرونده امنیتی بلایی به سرت می‌آورم که ذوب شوی!”
هرانا گزارش داده است، به گفته نزدیکان شاهین ناصری که پیش از مرگ، با او صحبت کرده‌اند، هیچ نشانه‌ای از افسردگی یا تصمیم به خودکشی در او وجود نداشته و بیشتر به دلیل تهدید شدن در زندان، بابت سلامتی خود در سلول انفرادی نگران بود.
این زندانی پس از اینکه درخصوص شکنجه نوید افکاری، شهادت داده بود، به زندان تهران بزرگ تبعید شده و از مدتی پیش در سلول انفرادی به‌سر می‌برده است.
صبح روز چهارشنبه ۳۱ شهریورماه، به خانواده شاهین ناصری اطلاع داده شد تا برای تحویل گرفتن جسد فرزند خود به دادسرای جنایی مراجعه کنند.
دو روز بعد از انتشار خبر مرگ این زندانی، روابط عمومی اداره کل زندان های تهران با انتشار اطلاعیه ضمن تایید مرگ پر ابهام شاهین ناصری، بدون ذکر جزییات مدعی شد: “این زندانی با شرایط اورژانسی به بهداری زندان منتقل و در محل بهداری، عملیات احیاء (ماساژ قلبی، تنفس مصنوعی و تزریق اپی نرفین و فیکس IV Line) به مدت ۴۵ دقیقه انجام می‌گیرد که علی رغم تلاش‌های کادر درمان، زندانی مورد اشاره فوت میکند.”
شهادت شاهین ناصری در مورد ضرب و شتم و شکنجه نوید و وحید افکاری در بازداشتگاه اداره آگاهی شیراز در پرونده مورد اشاره قرار گرفته بود اما این اظهارات هیچگاه مورد توجه دادگاه قرار نگرفت.
در فایل صوتی که زمان ضبط آن برای قبل از اعدام نوید افکاری است، شاهین ناصری به بیان بخشی از این شکنجه‌ها پرداخته و می‌گوید: “یک روز در آگاهی شیراز من را به محل شکنجه می‌بردند که در راهرو صدای داد و فریاد و التماس و فحاشی به گوشم رسید. وقتی جلوتر رفتم دیدم در یکی از اتاق ها دو نفر لباس شخصی نوید افکاری را به باد کتک گرفته و با فحش های بسیار بد و الفاظ رکیک و با بی رحمی تمام با لوله و باتوم بر سر و صورت نوید ضربه می‌زنند”.
او در ادامه این پیام صوتی بیان میکند: “من به وضوح شنیدم که شکنجه گران به نوید افکاری می‌گفتند هر چیزی را که ما می‌گوییم درست است و باید بنویسی. وقتی برای شهادت به دادسرای امنیتی رفتم بازپرس شعبه پس از شنیدن صحبت های من با الفاضی رکیک گفت که تو داری در یک پرونده امنیتی دخالت می‌کنی. همین ماموران را وادار میکنم به خاطر تهمت و افترا از تو شکایت بکنند و بلایی سرت می‌آورم که ذوب بشوی”.
پیشتر یک منبع نزدیک به خانواده آقای ناصری در گفتگو با گزارشگر هرانا گفت: چند روز پیش مصادف با سالگرد اجرای حکم اعدام نوید افکاری از سالن محل حبس خود در زندان تهران بزرگ به مکان نامعلومی منتقل شد. ما فکر می‌کردیم که به یک نهاد امنیتی منتقل شده، چون بارها توسط نهادهای امنیتی مورد تهدید قرار گرفته بود تا درباره پرونده برادران افکاری سکوت کند، اما چند روز قبل متوجه شدیم که در محلی در زندان تهران بزرگ بسر می‌برد. شاهین ناصری هیچ بیماری زمینه‌ای نداشت و مرگ او کاملا ناگهانی و مشکوک است.
بابک پاک‌نیا، وکیل دادگستری که وکالت تعدادی از زندانیان سیاسی را برعهده داشته است، با انتشار مطلبی در فضای مجازی درباره مرگ شاهین ناصری نوشته؛ شاهین یک روز قبل از مرگ با تلفن زندان تهران بزرگ با من تماس گرفت و ضمن اینکه خواست وکالتش را مجددا برعهده بگیرم، گفته که از بند خارج شده و تلفن هم در اختیارش نیست و کارتش را گرفتند و از کارت دوستش استفاده میکند.